EN
RNDr. Milan Kožíšek, Ph.D.

RNDr. Milan Kožíšek, Ph.D.

mail milan.kozisekinvalid-email-name@invalid-email-domainuochb.cas.cz
phone +420 220 183 518
Zástupce vedoucího skupiny
Skupina Jana Konvalinky
Proteázy lidských patogenů

Profil

VZDĚLÁNÍ
1998-2003

Student Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze, obor biochemie. Vzdělání ukončeno státní zkouškou v r.2003 a byl udělen titul Mgr.

V letech 2001 – 2003 byla vykonána diplomová práce „Rezistence u HIV pozitivních pacientů léčených inhibitory HIV proteasy“ na Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd ČR pod vedením doc. RNDr. Jana Konvalinky, CSc.

V roce 2004 udělen titul RNDr. po státní rigorózní zkoušce.


2006-2010

Student kombinovaného doktorského studia na Přírodovědecké fakultě UK a Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR.

Disertační práce : „Objev, návrh a charakterizace nových nepeptidových inhibitorů HIV-1 proteasy“.

VĚDECKÉ A AKADEMICKÉ POZICE
od roku 2010

Vědecký pracovník ve skupině Prof. Jana Konvalinky, Ph.D. na Ústavu organické chemie a biochemie Akademie věd České republiky

od roku 2018

Školitel studentů doktorského studia na 1. lékařské fakultě University Karlovy v Praze

OCENĚNÍ
2014

Prémie Otto Wichterleho vybraným, mimořádně kvalitním a perspektivním vědeckým pracovníkům Akademie věd České republiky, kteří přispívají vynikajícími výsledky k rozvoji vědeckého poznání

2011

Cena Josefa Hlávky pro talentované studenty v bakalářském, magisterském a doktorském studiu, kteří prokázali výjimečné schopnosti a tvůrčí myšlení ve svém oboru

2008

Cena poroty za nejlepší plakátovou prezentaci „Kinetic, Structural and Thermodynamic Characterization of HIV Protease with Insertion in the Flap Region Isolated from and HIV-Positive Patient“ na konferenci Applications of Biocalorimetry (abc6) v Heidelbergu, Německo

Načíst více
HLAVNÍ VĚDECKÉ ZÁJMY

Racionální návrh a charakterizace inhibitorů chřipkové polymerasy

Hejdánek et al. Antivir Res 2021; Gregor et al. Molecules 2021; Zima et al. Eur J Med Chem 2020

Racionální návrh a charakterizace inhibitorů chřipkové neuraminidasy
Zima et al. Bioorg Med Chem 2019; Pokorná et al. Viruses 2018; Berenguer Albiñana et al. Eur J Med Chem 2016

Mikrokalorimetrie při studiu molekulárních interakcí biomolekul a stability proteinů 
Vavřina et al. Biochemistry 2021; Rulíšek et al. Angew Chem Int Ed 2021; Began et al. EMBO J 2020; Heyda et al. J Phys Chem B 2011; Vaněk et al. J Med Chem 2009; Řezáčová et al. Mol Microbiol 2008; Král et al. Proteins 2008; Kožíšek et al. Eur J Biochem 2008; Vondrášek et al. Chem Eur J 2007

Metody pro studium interakcí protein-protein a protein-ligand (HTS, AlphaScreen, SPR, ITC, DSC)
Kožíšek et al. Biochem J 2018; Trempe et al. Sci Rep 2016; Sivá et al. Sci Rep 2016; Németh et al. J Inorg Biochem 2015; Rozbeský et al. Int J Mol Sci 2014; Németh et al. Protein Sci 2014; Németh et al. J Biol Inorg Chem 2014; Motáčková et al. Biomol NMR Assign 2009

Studium resistence u HIV pozitivních pacientů léčených inhibitory HIV proteasy
Kožíšek et al. FEBS J 2014; Grantz Šašková et al. J Virol 2014; Schimer et al. J Med Chem 2012; Kožíšek et al. Antimicrob Agents Chemother 2012; Grantz Šašková et al. J Virol 2009; Grantz Šašková et al. Protein Sci 2008; Bartoňová et al. Antivir Res 2008; Kožíšek et al. J Mol Biol 2007

Racionální návrh a charakterizace metalokarboranových inhibitorů HIV-1 proteasy 
Řezáčová et al. J Med Chem 2009; Kožíšek et al. J Med Chem 2008; Kubát et al. J Phys Chem B 2007; Cígler and Kožíšek et al. Proc Natl Acad Sci USA 2005

Studium inzercí v HIV protease
Kožíšek et al. J Virol 2008

Studium kapsidového proteinu a sbalování viru HIV
Machara et al. J Med Chem 2016; Kožíšek et al. Bioorg Med Chem Lett 2016; Doležal et al. J Biol Chem 2016

Všechny publikace

Nejnovější publikace

3′-Dehydroxypurpurogallin-4-Carboxamides as Influenza A Endonuclease Inhibitors: Synthesis, Structure-Activity Relationship Analysis, and Structural Characterization of Protein Complex
M. Kráľ T. Kotačka R. Reiberger G. Panýrková K. Radilová Z. Osifová M. Flieger J. Konvalinka P. Majer M. Kožíšek A. Machara
ChemMedChem 2024: Early View
Přejít na publikaci arrow
Apollon: a deoxyribozyme that generates a yellow product
M. Volek J. Kurfürst M. Kožíšek P. Srb V. Veverka E. A. Curtis
Nucleic Acids Research 52 (15): 9062–9075 (2024)
Přejít na publikaci arrow
Thermodynamic and structural characterization of an optimized peptide-based inhibitor of the influenza polymerase PA-PB1 subunit interaction
K. Radilová V. Zima M. Kráľ A. Machara M. Majer J. Hodek J. Weber T. Strmeň J. Konvalinka M. Kožíšek
Antiviral Research 208: 105449 (2022)
Přejít na publikaci arrow
Synthesis and In Vitro Evaluation of C-7 and C-8 Luteolin Derivatives as Influenza Endonuclease Inhibitors
R. Reiberger K. Radilová M. Kráľ V. Zima P. Majer J. Brynda M. Dračínský J. Konvalinka M. Kožíšek A. Machara
International Journal of Molecular Sciences 22 (14): 7735 (2021)
Přejít na publikaci arrow