Sekvenčně specifická enzymová syntéza RNA s modifikovanými bázemi
Bioorganická a medicinální chemie nukleových kyselin
Abstrakt
Budeme designovat a syntetizovat modifikované ribonukleosid trifosfáty nesoucí různé funkční skupiny na nukleobázi. Tyto nukleotidy budou využity pro sekvenčně specifickou enzymovou syntézu oligonukleotidů (RNA) nesoucích značky nebo modifikace ve specifických polohách pomocí upravených DNA polymeras. Aplikace budou zahrnovat tRNA, mRNA, sgRNA apod.
Obor studia: Organická chemie
Reference:
- Micura, R.; Höbartner, C. Fundamental studies of functional nucleic acids: aptamers, riboswitches, ribozymes and DNAzymes. Chem. Soc. Rev. 2020, 49, 7331–7353.
- Milisavljevic, N.; Perlíková, P.; Pohl, R.; Hocek, M. Enzymatic synthesis of base-modified RNA by T7 RNA polymerase. A systematic study and comparison of 5-substituted pyrimidine and 7-substituted 7-deazapurine nucleoside triphosphates as substrates. Org. Biomol. Chem. 2018, 16, 5800-5807.
Vysoké školy
Studenti doktorského studia musí být zapsáni na partnerské univerzitě a zároveň budou zaměstnáni na ÚOCHB na částečný nebo plný úvazek, což zajistí zajímavé finanční ohodnocení (univerzitní stipendium + plat na ÚOCHB). Každá univerzita má svůj vlastní přijímací proces, včetně termínů pro přihlášky, který je oddělený od přijímacího řízení na ÚOCHB. Podrobnosti můžete projednat s příslušným tutorem.
Jak se přihlásit
V případě zájmu kontaktujte vedoucího projektu: michal.hocek@uochb.cas.cz